Das Exekutivdepartment ist die oberste Instanz innerhalb der European Fly Fishing Association. Es leitet die Organisation nach den ihr zu Grunde liegenden Statuten. Das ED setzt sich zusammen aus dem Präsidenten, dem Vize-Präsidenten, dem Sekretär, dem Kassier, den Kassenprüfern sowie den Vertretern der Mitgliederländer und den Vorsitzenden der einzelnen Sektionen der EFFA.

Die einzelnen Sektionen der EFFA versuchen ihren Bereich in einer mehr oder weniger autonomen Art zu leiten. Das bedeutet, dass sie innerhalb ihrer Sektion ihre eigenen Strukturen bilden, um ihre Arbeit auf möglichst effiziente Art zu verrichten. Die Mitglieder dieser Abteilungen wählen ihren Vorsitzenden, der die Abteilung dann im ED repräsentiert.

Das Ziel der EFFA ist der Aufbau möglichst vieler nationaler EFFA Councils, die die Ziele der EFFA in ihrem Land umzusetzen versuchen. Nationale EFFA Councils sind lose Verbindungen von EFFA Mitgliedern (Keine Organisation als Vereine innerhalb der EFFA!) in den jeweiligen Ländern. Sie sollen den EFFA Mitgliedern ihres Landes verschiedenste Aktivitäten anbieten, um das Zusammengehörigkeitsgefühl unter den Fliegenfischern zu stärken. Der Repräsentant dieser Vertretungen vertritt die Interessen seines Landes dann im Exekutivdepartment der EFFA. Voraussetzung zum Beitritt einer Länderorganisation ist die Direktmitgliedschaft bei der EFFA. Die Teilnahme und Mitarbeit an den Aktivitäten  der   Länderorganisationen ist freiwillig.

Die Anliegen und Meinungen der Mitglieder sowie Instruktoren und Guides werden über ihre nationalen Vertreter ins ED getragen. Sie haben die Möglichkeit, sich in den verschiedenen Sektionen einzubringen und damit mitzuhelfen, die EFFA aktiv mitzugestalten.